Поздним разрушающим трупным изменением является гниение. Гниение представляет собой разложение сложных органических соединений под воздействием микроорганизмов до более простых. В конце концов в результате гниения происходит полное разложение белков, жиров, углеводов и других биологических веществ с образованием воды, сероводорода, углекислого газа, аммиака, метана и других соединений.

Время проявления тех или иных гнилостных изменений при наружном исследовании трупа весьма вариабельно. Грязно-зеленая окраска кожи в подвздошных областях появляется на 2 - 3 сутки, но летом или в теплых условиях может появиться уже в конце первых или начале вторых суток. На 4 - 5 день вся передняя брюшная стенка и половые органы приобретают такую же окраску. К конце второй недели развивается трупный гигантизм. На третьей недели разложение трупа усиливается. Ткани становятся все более ослизлыми, легко разрываются. На 3 - 6 месяце прекращается образование гнилостных газов, трупная эмфизема исчезает, объем трупа уменьшается. Постепенно мягкие ткани и внутренние органы расплавляются и происходит скелетизация трупа. Наиболее устойчивыми к гниению являются связки, но и они уступают этому процессу и, примерно через год, кости скелета не связаны между собой, наступила полная скелетизация.

Поздние трупные изменения дают менее точные данные о давности наступления смерти, так как могут установить только приблизительный момент смерти.